Application note - Automatisierte Probenlagerung
im größten Screening-Netzwerk für chemische
Biologie in Europa
EU-OPENSCREEN
Abstract
EU-OPENSCREEN betreibt eine öffentlich zugängliche Datenbank mit einer einzigartigen Sammlung chemischer Substanzen. Mit über 20 angeschlossenen Hochdurchsatz-Screening- und Chemieeinrichtungen an Partnerstandorten in zehn europäischen Ländern ermöglicht EU-OPENSCREEN Forschern den Zugang zu führenden Technologien, um eigene aktive Verbindungen zu erforschen und zu entwickeln.
Für den hochkomplexen Prozess der automatisierten Lagerung von in Dimethylsulfoxid (DMSO) gelösten Substanzen bei –20°C werden LVL SAFE® 2D Röhrchen und Racks von LVL Technologies sowie der LVL SAFE® 8-Kanal und 96-Kanal Capper/Decapper verwendet. Dank der ausgezeichneten Qualität und Dichtheit der Röhrchen, der zuverlässigen Lesbarkeit und fehlerfreien Codes sowie der außergewöhnlichen Kompatibilität der Röhrchen mit dem Capper/Decapper und den Automatisierungssystemen wird ein reibungsloser Prozess gewährleistet. Mehr als 100.000 Proben werden in LVL SAFE® 2D Röhrchen gelagert.
Symbiose von chemischer Expertise und Biomedizin
Die BioBank Dresden ist eine Klinikum-integrierte Biobank. Innerhalb der Biobank werden qualitätsgesichert und datenschutzkonform Bioproben von Patienten und gesunden Probanden aufgearbeitet und gelagert. Die Gewebe- und Flüssigproben werden im Kontext der Routinediagnostik und -therapie aus Operationen, Biopsien, Punktionen, Blut- oder Urinabnahmen gewonnen und nach Einwilligung der Patienten in die BioBank Dresden transferiert. Aktuell verwaltet die BioBank über 100.000 Bioproben. Ein Ausbau der Infrastruktur, um die Lagerkapazitäten auf über 5 Mio. Bioproben zu erhöhen, ist gestartet.
Die Akkreditierung nach DIN EN ISO 20387 erfolgt in Kürze.
Mit Ihrer Probensammlung unterstützt die BioBank Dresden zahlreiche Forschungsprojekte und leistet damit einen wichtigen Beitrag, Krankheiten besser zu verstehen, effizienter zu therapieren und zu heilen.
Es werden Bioproben von verschiedenen Erkrankungen verwaltet und der Forschung zur Verfügung gestellt. Dazu gehören beispielhaft Patientenproben von gastrointestinalen Tumoren, Lymphomen, dermatologischen Karzinomen, urologischen Tumoren, aber auch von nichtonkologischen Erkrankungen wie der Immunthrombozytenpenie, Covid-19 oder neurologischen Erkrankungen. Die bisher von Wissenschaftlern untersuchten Proben führten zu Erkenntnisgewinn und Veröffentlichungen in Fachjournalen.
- Beschaffung gekaufter chemischer Substanzen von über 50 weltweiten kommerziellen Lieferanten, geliefert in bereitgestellten LVL SAFE® 2D Röhrchen in der gewünschten Konzentration in DMSO oder als feste Substanz.
- Handhabung der Proben in LVL SAFE® 2D Röhrchen, einschließlich der Zuordnung aller Substanzinformationen zum LVL 2D-Code, Handhabung der Röhrchen in den Laboren der jeweiligen Lieferanten mit dem LVL SAFE® 8-Kanal-Capper/Decapper.
- In etwa 10% der Fälle Lieferung von Substanzen aus akademischen Laboren in Röhrchen mit größeren Volumina zur einfacheren Handhabung – Transfer der Substanzen/Lösungen von diesen Röhrchen in LVL SAFE® 2D Röhrchen in den EU-OPENSCREEN-Laboren für die Weiterverarbeitung und Lagerung nach den Standardverfahren.
- Je nach Lieferzustand Vorbereitung für die Lagerung im Pipettierroboter, Umformatierung, etc. – automatisches Öffnen und Schließen der Röhrchen unter Verwendung des integrierten LVL SAFE® 96-Kanal-Capper/Decappers im Prozess.
- Transfer der LVL Racks mit vorbereiteten Proben in 2D Röhrchen in das automatisierte Lagersystem zur Lagerung bei –20°C, einschließlich eines festgelegten Einfrierprozesses im Lagersystem.
- Bereitstellung ausgewählter Proben für Forschungsprojekte:
- Datenbankgesteuerte Auswahl und automatisiertes Picking der Röhrchen im Lagersystem
- Transfer von Teilvolumina der jeweiligen DMSO-Lösungen in Mikrotiterplatten unter Verwendung eines Pipettierroboters für den Versand an Wissenschaftler in ganz Europa.
Kundenfeedback
Benutzererfahrung & Vorteile
Kompatibilität mit Geräten und dem gesamten Prozessablauf
- Zuverlässige Lesbarkeit des Codes, sowohl maschinenlesbar als auch manuell, in beiden Dimensionen – 2D-Code am Boden und Barcode an der Seite.
- Die Kompatibilität von Röhrchen und Racks mit den Geräten erfüllt alle Anforderungen für einen reibungslosen Ablauf. Es gibt keine Einschränkungen bei der Prozessabbildung mit automatisierten Systemen wie Pipettierrobotern, Zellisolationsrobotern, Gefrierrobotern und automatischen Stickstofflagersystemen.
- Sehr gute Handhabung für manuelle Prozesse im Labor.
- Geeignet für den Einsatz bei verschiedenen Temperaturen, sowohl für die Verarbeitung bei Raumtemperatur als auch für die Lagerung bei –20°C, –80°C und in der Gasphase von Flüssigstickstoff bei –196°C.
Umfassendes Produktportfolio an 2D Röhrchen mit exzellenten Produkteigenschaften ermöglicht eine optimale Auswahl geeigneter Produkte für spezifische Anforderungen
- Die Röhrchen haben ein Außengewinde, was Kontamination/Übertragung deutlich reduziert.
- Die Röhrchen sind geeignet für die Lagerung von Substanzen im gewünschten organischen Lösungsmittel DMSO (Dimethylsulfoxid) – geringes auslaugbares Material, IATA-zertifizierte Leckdichtigkeit durch eingespritztes TPE-Verschluss. Dieses Produkteigenschaft war entscheidend für die Kaufentscheidung.
- Der Barcode ist maschinenlesbar, auch bei farbigen Lösungen – dies konnte mit vorher verwendeten Lösungen aufgrund der Transparenz der Röhrchen nicht gewährleistet werden.
Zuverlässige Produkt- und Lieferqualität als Voraussetzung für den langfristigen Einsatz
- Die Produktqualität der Röhrchen und Racks ist konstant auf höchstem Niveau, mit einer extrem niedrigen Ausfallrate.
- LVL akzeptiert individuelle Einkaufs- und Lieferkonzepte, die sicher und effektiv umgesetzt werden.
- Flexible Lieferoptionen, wie Röhrchen mit vorab befestigten Schraubverschlüssen oder separate Lieferung von Röhrchen und Schraubverschlüssen.
Einsatz des LVL SAFE® Capper/Decapper für automatisiertes Röhrchenversiegeln sehr zufriedenstellend
- Die automatische Versiegelungsfähigkeit stellte eine entscheidende Grundlage zur Optimierung des automatisierten Workflows dar.
- Cappers und Röhrchen sind perfekt aufeinander abgestimmt. Es ist keine Adapterplatte erforderlich, die unerwünschte Komplikationen verursachen könnte. Das Konzept der Rackzufuhr zum festen Kopf zeigt sich als positiv hinsichtlich der reibungslosen Nutzung und der Robustheit des gesamten Systems.